Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM28Q13263 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM28Q13263 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM28Q13263 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM28Q13263 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM28Q13263 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM28Q13263 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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