Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2AQ12879 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2AQ12879 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2AQ12879 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms