Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 SLH1YGR271W 5904 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YCR013CYCR013C 648 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 CKA1YIL035C 1119 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YLR012CYLR012C 300 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 SPC2YML055W 537 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 HAT1YPL001W 1125 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 TRZ1YKR079C 2517 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 RTT10YPL183C 3042 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YEL043WYEL043W 2871 nt2.51□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 HSE1YHL002W 1359 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 SDC1YDR469W 528 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 GLC7YER133W 939 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 MTM1YGR257C 1101 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YLR198CYLR198C 360 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 VPS63YLR261C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YNL046WYNL046W 519 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 SPR2YOR214C 711 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 CUR1YPR158W 759 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 RAD18YCR066W 1464 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 DAL5YJR152W 1632 nt2.5□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 CDC37YDR168W 1521 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YCR090CYCR090C 549 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 RPS17BYDR447C 411 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YAL064WYAL064W 285 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 SAS2YMR127C 1017 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 SFM1YOR021C 642 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 PEP12YOR036W 867 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 VID24YBR105C 1089 nt2.49□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 INO80YGL150C 4470 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 SHS1YDL225W 1656 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 ATP16YDL004W 483 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YRB1YDR002W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 PIB1YDR313C 861 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 NTF2YER009W 378 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 MPO1YGL010W 525 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 TWF1YGR080W 999 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 PEX4YGR133W 552 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 COX3Q0275 810 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YJR020WYJR020W 333 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 BCK1YJL095W 4437 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 PRP6YBR055C 2700 nt2.48□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YOL098CYOL098C 3114 nt2.47□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 COG2YGR120C 789 nt2.47□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 ILV5YLR355C 1188 nt2.47□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 COX8YLR395C 237 nt2.47□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 SUS1YBR111W-A 291 nt2.47□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YPR089WYPR089W 2667 nt2.47□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 YPL150WYPL150W 2706 nt2.47□□□□□ -2.01
NFI1Q12216 AYT1YLL063C 1425 nt2.46□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 RPS26BYER131W 360 nt2.46□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 BMT5YIL096C 1011 nt2.46□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YPT6YLR262C 648 nt2.46□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.46□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 RSE1YML049C 4086 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YPR097WYPR097W 3222 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 RSM28YDR494W 1086 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 PRE1YER012W 597 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 ACB1YGR037C 264 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YLL044WYLL044W 447 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 RPS16AYMR143W 432 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 VMA9YCL005W-A 222 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 DBP10YDL031W 2988 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 RIF1YBR275C 5751 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 SEC26YDR238C 2922 nt2.45□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 RGA1YOR127W 3024 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 CBF2YGR140W 2871 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 ELG1YOR144C 2376 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 MMS22YLR320W 4365 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 DSF2YBR007C 2211 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YDR193WYDR193W 399 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 LOC1YFR001W 615 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YGL218WYGL218W 651 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YAL066WYAL066W 309 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YMR320WYMR320W 306 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 ATG3YNR007C 933 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 SFG1YOR315W 1041 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YBR051WYBR051W 351 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 AME1YBR211C 975 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 UBX3YDL091C 1368 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 VPS64YDR200C 1815 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 KSP1YHR082C 3090 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 GIS1YDR096W 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 DCP1YOL149W 696 nt2.43□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YBR197CYBR197C 654 nt2.43□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YHR078WYHR078W 1659 nt2.43□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 SNU114YKL173W 3027 nt2.43□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 VPS38YLR360W 1320 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 YRR1YOR162C 2433 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 GIN4YDR507C 3429 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 HAA1YPR008W 2085 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 DAD1YDR016C 285 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 TIF35YDR429C 825 nt2.42□□□□□ -2.02
NFI1Q12216 TIM9YEL020W-A 264 nt2.42□□□□□ -2.02
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