Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNE2O96020 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNE2O96020 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms