Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARFGEF2Q9Y6D5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms