Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms