Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIRT1Q96EB6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIRT1Q96EB6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms