Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC82Q8N4S0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC82Q8N4S0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms