Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCTN1Q2MV58 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCTN1Q2MV58 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCTN1Q2MV58 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCTN1Q2MV58 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCTN1Q2MV58 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCTN1Q2MV58 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCTN1Q2MV58 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCTN1Q2MV58 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 651.6 ms