Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 TMA20YER007C-A 546 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 DSE2YHR143W 978 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 TPK3YKL166C 1197 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 ATG10YLL042C 504 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 YLL044WYLL044W 447 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 RLP24YLR009W 600 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 YNL184CYNL184C 327 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 YNL235CYNL235C 432 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 MEI5YPL121C 669 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 YBP2YGL060W 1926 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 MSH2YOL090W 2895 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 SOK1YDR006C 2706 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 VIP1YLR410W 3441 nt2.54□□□□□ -2
VHS1Q03785 DUF1YOL087C 3351 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 AEP1YMR064W 1557 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 SWC4YGR002C 1431 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 PDR1YGL013C 3207 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 YFH7YFR007W 1062 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 VAR1Q0140 1197 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 YIL082WYIL082W 873 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 ECI1YLR284C 843 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 JID1YPR061C 906 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 VPS41YDR080W 2979 nt2.53□□□□□ -2
VHS1Q03785 ICR1ICR1 3199 nt2.53□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YDR186CYDR186C 2634 nt2.53□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RED1YLR263W 2484 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 FKS3YMR306W 5358 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 MFB1YDR219C 1398 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SMC2YFR031C 3513 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 snR5snR5 204 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 snR68snR68 136 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YDL016CYDL016C 303 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YJL119CYJL119C 324 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YKL070WYKL070W 510 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 NYV1YLR093C 762 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YMR181CYMR181C 465 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YOL029CYOL029C 606 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 PFY1YOR122C 381 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YRO2YBR054W 1035 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YBR071WYBR071W 636 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YPR170CYPR170C 336 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SRP1YNL189W 1629 nt2.52□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 NEW1YPL226W 3591 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 AYT1YLL063C 1425 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 PDR3YBL005W 2931 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 DAD1YDR016C 285 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 HLR1YDR528W 1272 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 HYP2YEL034W 474 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 APQ13YJL075C 417 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RPA12YJR063W 378 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YKL069WYKL069W 543 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 GMC2YLR445W 567 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RPL6BYLR448W 531 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 GIM3YNL153C 390 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 GAL7YBR018C 1101 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 snR35snR35 204 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SRO77YBL106C 3033 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 HAA1YPR008W 2085 nt2.51□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 MMS1YPR164W 4224 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 KEL2YGR238C 2649 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YCT1YLL055W 1596 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YDR018CYDR018C 1191 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RTT105YER104W 627 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YET1YKL065C 621 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YKE2YLR200W 345 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 TAP42YMR028W 1101 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RUF22RUF22 515 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RPL23AYBL087C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 INO4YOL108C 456 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 GCY1YOR120W 939 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 LTP1YPR073C 486 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 REG1YDR028C 3045 nt2.5□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 SRP68YPL243W 1800 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 MPS1YDL028C 2295 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 PHO81YGR233C 3537 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 VHR2YER064C 1518 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YDR239CYDR239C 2364 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 FMN1YDR236C 657 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 PRS3YHL011C 963 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 GIC1YHR061C 945 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 ENV10YLR065C 546 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 ATP19YOL077W-A 207 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 GRE2YOL151W 1029 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 RBL2YOR265W 321 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YOR364WYOR364W 369 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 CUR1YPR158W 759 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YCG1YDR325W 3108 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 TPO5YKL174C 1857 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YJL132WYJL132W 2253 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 VAC14YLR386W 2643 nt2.49□□□□□ -2.01
VHS1Q03785 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms