Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ART10YLR392C 1557 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 BNI1YNL271C 5862 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 TAE2YPL009C 3117 nt2.22□□□□□ -2.05
DDI1P40087 POM152YMR129W 4014 nt2.21□□□□□ -2.05
DDI1P40087 ESA1YOR244W 1338 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 NUR1YDL089W 1455 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 BUD26YDR241W 288 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 SWA2YDR320C 2007 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YGR050CYGR050C 357 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 NYV1YLR093C 762 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PRE8YML092C 753 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YRO2YBR054W 1035 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YKL075CYKL075C 1353 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PHO91YNR013C 2685 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YEL1YBL060W 2064 nt2.21□□□□□ -2.06
DDI1P40087 IRC8YJL051W 2469 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 SDC25YLL016W 3147 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 MCD1YDL003W 1701 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 SGS1YMR190C 4344 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 KRE33YNL132W 3171 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 GIC2YDR309C 1152 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YMR31YFR049W 372 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YGR111WYGR111W 1203 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 GTR2YGR163W 1026 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 GPI14YJR013W 1212 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YKL115CYKL115C 393 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 RPL36AYMR194W 303 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 HAT1YPL001W 1125 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 KAR4YCL055W 1008 nt2.2□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YCT1YLL055W 1596 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 BRE5YNR051C 1548 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 SEM1YDR363W-A 270 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 VAB2YEL005C 849 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 MPO1YGL010W 525 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YGL218WYGL218W 651 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 ATG19YOL082W 1248 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 RPB8YOR224C 441 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YOR283WYOR283W 693 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PDR11YIL013C 4236 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YDR186CYDR186C 2634 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 ARP5YNL059C 2268 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 NPR3YHL023C 3441 nt2.19□□□□□ -2.06
DDI1P40087 FUS2YMR232W 2034 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PUF4YGL014W 2667 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 SIP3YNL257C 3690 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 FUS1YCL027W 1539 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 MPC1YGL080W 393 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 IRC21YMR073C 606 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 MTG1YMR097C 1104 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 ESF2YNR054C 951 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 CSI2YOL007C 1026 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YOR366WYOR366W 354 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 UBS1YBR165W 834 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 FKS3YMR306W 5358 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YNL018CYNL018C 1839 nt2.18□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PDR3YBL005W 2931 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 MRP10YDL045W-A 288 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 snR76snR76 109 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 RUB1YDR139C 234 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 SLD5YDR489W 885 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YJR020WYJR020W 333 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 MRP49YKL167C 414 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 CBP6YBR120C 489 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PEX34YCL056C 435 nt2.17□□□□□ -2.06
DDI1P40087 MSB1YOR188W 3414 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 DNF1YER166W 4716 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 HOS4YIL112W 3252 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PEX18YHR160C 852 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YJL202CYJL202C 348 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 PET191YJR034W 327 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 HYM1YKL189W 1200 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 ATX1YNL259C 222 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 YAP7YOL028C 738 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 CUP9YPL177C 921 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 RFC5YBR087W 1065 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 NOP14YDL148C 2433 nt2.16□□□□□ -2.06
DDI1P40087 RLF2YPR018W 1821 nt2.15□□□□□ -2.06
DDI1P40087 SMC6YLR383W 3345 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SCY1YGL083W 2415 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SNA4YDL123W 423 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 VPH2YKL119C 648 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ATG10YLL042C 504 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 PAU23YLR037C 375 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RGM1YMR182C 636 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YOL162WYOL162W 648 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 CRS5YOR031W 210 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 PET20YPL159C 762 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 OSW7YFR039C 1533 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 EDS1YBR033W 2760 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 COG3YER157W 2406 nt2.15□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SAP185YJL098W 3177 nt2.14□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YDR250CYDR250C 276 nt2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms