Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERCC5P28715 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC5P28715 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms