Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP8A1Q9Y2Q0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms