Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NECAP2Q9NVZ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NECAP2Q9NVZ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms