Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFCC1Q9HA90 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms