Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIRT1Q96EB6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIRT1Q96EB6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms