Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms