Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHA9Q7RTU4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHA9Q7RTU4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms