Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC93Q567U6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC93Q567U6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms