Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODF4Q2M2E3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms