Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD1Q15797 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD1Q15797 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD1Q15797 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD1Q15797 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD1Q15797 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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