Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NID2Q14112 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NID2Q14112 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NID2Q14112 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NID2Q14112 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NID2Q14112 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NID2Q14112 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms