Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GRIN2AQ12879 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GRIN2AQ12879 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms