Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YGR011WYGR011W 327 nt1.71□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.71□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 PIS1YPR113W 663 nt1.71□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 GAS2YLR343W 1668 nt1.71□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 KDX1YKL161C 1302 nt1.71□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 EAF5YEL018W 840 nt1.71□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YBR089WYBR089W 600 nt1.71□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 UTP6YDR449C 1323 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 VMR1YHL035C 4779 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 TOP2YNL088W 4287 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 ERP3YDL018C 678 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 NRG1YDR043C 696 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 GLG2YJL137C 1143 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 RPS0BYLR048W 759 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YBR134WYBR134W 402 nt1.7□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 SRO9YCL037C 1305 nt1.69□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 SET4YJL105W 1683 nt1.69□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 PAM16YJL104W 450 nt1.69□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 ARG2YJL071W 1725 nt1.69□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 DUF1YOL087C 3351 nt1.69□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 ISW2YOR304W 3363 nt1.69□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 CDC53YDL132W 2448 nt1.68□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 BUR2YLR226W 1188 nt1.68□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 PEX12YMR026C 1200 nt1.68□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 RPL20AYMR242C 519 nt1.68□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 CYC2YOR037W 1101 nt1.68□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 NPR1YNL183C 2373 nt1.68□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YDR115WYDR115W 318 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 MIG2YGL209W 1149 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 EST3YIL009C-A 546 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YOL166CYOL166C 339 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 RAV2YDR202C 1056 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 COS12YGL263W 1143 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 CTP1YBR291C 900 nt1.67□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 IOC4YMR044W 1428 nt1.66□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 KXD1YGL079W 657 nt1.66□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 NDJ1YOL104C 1059 nt1.66□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YPR078CYPR078C 1119 nt1.66□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 YMR045CYMR045C 5268 nt1.66□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 KCS1YDR017C 3153 nt1.66□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 ATP25YMR098C 1839 nt1.65□□□□□ -2.14
DNF3Q12674 MRP10YDL045W-A 288 nt1.65□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 VPH2YKL119C 648 nt1.65□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 NEM1YHR004C 1341 nt1.65□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 TOM70YNL121C 1854 nt1.65□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 WBP1YEL002C 1293 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 RPL33BYOR234C 324 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 DBP5YOR046C 1449 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 MGA1YGR249W 1371 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YGL117WYGL117W 798 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 AAR2YBL074C 1068 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YOR289WYOR289W 756 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 SPP382YLR424W 2127 nt1.64□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 COG2YGR120C 789 nt1.63□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 RLP7YNL002C 969 nt1.63□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 HCH1YNL281W 462 nt1.63□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 NDC80YIL144W 2076 nt1.63□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 HFM1YGL251C 3564 nt1.63□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 EAF1YDR359C 2949 nt1.63□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 SPT14YPL175W 1359 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YGR237CYGR237C 2358 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 HPA3YEL066W 540 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YGL069CYGL069C 465 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 RPL1BYGL135W 654 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 OST5YGL226C-A 261 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 TPP1YMR156C 717 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 RPL1AYPL220W 654 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YPK3YBR028C 1578 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 CIK1YMR198W 1785 nt1.62□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 RKM1YPL208W 1752 nt1.61□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 AIM14YGL160W 1713 nt1.61□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 PMI40YER003C 1290 nt1.61□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 DSE4YNR067C 3354 nt1.6□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 URC2YDR520C 2319 nt1.6□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 PRP18YGR006W 756 nt1.6□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 MRPL6YHR147C 645 nt1.6□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.6□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YPR146CYPR146C 330 nt1.6□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 RPN9YDR427W 1182 nt1.59□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.59□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YIL086CYIL086C 309 nt1.59□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 YLR416CYLR416C 399 nt1.59□□□□□ -2.15
DNF3Q12674 ALG8YOR067C 1734 nt1.59□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 RRP8YDR083W 1179 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 MPD2YOL088C 834 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 HHF1YBR009C 312 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 UTP25YIL091C 2166 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 MAD1YGL086W 2250 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 CDC25YLR310C 4770 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 HKR1YDR420W 5409 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 YGR111WYGR111W 1203 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 HTA2YBL003C 399 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 YLR366WYLR366W 306 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 MBA1YBR185C 837 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 APA1YCL050C 966 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 DIA2YOR080W 2199 nt1.58□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 YIL080WYIL080W 4722 nt1.57□□□□□ -2.16
DNF3Q12674 ENP2YGR145W 2124 nt1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.9 ms