Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 ERT1YBR239C 1590 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 AGE1YDR524C 1449 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YFR054CYFR054C 579 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YGL039WYGL039W 1047 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 IKI1YHR187W 930 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YAR069CYAR069C 294 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 ARC18YLR370C 537 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YNL089CYNL089C 477 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YOR277CYOR277C 309 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 AFT2YPL202C 1251 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YBR090CYBR090C 369 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YGR067CYGR067C 2415 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 CYR1YJL005W 6081 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 FKS3YMR306W 5358 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 POM152YMR129W 4014 nt2.44□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 SWR1YDR334W 4545 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YBP2YGL060W 1926 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 RIM1YCR028C-A 408 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 TVP15YDR100W 432 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 SAE2YGL175C 1038 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 CTK2YJL006C 972 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YJL032WYJL032W 315 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 SMD2YLR275W 333 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 FAR3YMR052W 615 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 DYN3YMR299C 939 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 SPR2YOR214C 711 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 MRPL40YPL173W 894 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YJL049WYJL049W 1353 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 ANR2YKL047W 1551 nt2.43□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 PIG2YIL045W 1617 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 TRM2YKR056W 1920 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 ATG13YPR185W 2217 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 ICR1ICR1 3199 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 TFC4YGR047C 3078 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 RSM27YGR215W 333 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 GPX1YKL026C 504 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 CWC24YLR323C 780 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 RPL23AYBL087C 414 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YOL134CYOL134C 390 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 GRX5YPL059W 453 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 CIN2YPL241C 807 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 SUL1YBR294W 2580 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 AYT1YLL063C 1425 nt2.42□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YPP1YGR198W 2454 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 RLI1YDR091C 1827 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YFL015CYFL015C 495 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YHR213WYHR213W 597 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YAR062WYAR062W 597 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 COQ10YOL008W 624 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 MGE1YOR232W 687 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YJL132WYJL132W 2253 nt2.41□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 YBT1YLL048C 4986 nt2.4□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 NOP12YOL041C 1380 nt2.4□□□□□ -2.02
PRP46Q12417 ATP16YDL004W 483 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 ATC1YDR184C 885 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 PNC1YGL037C 651 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 MIG2YGL209W 1149 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 GTR2YGR163W 1026 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RPC25YKL144C 639 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 TDA8YAL064C-A 381 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RPC40YPR110C 1008 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RFC5YBR087W 1065 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 TOP2YNL088W 4287 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 SLF1YDR515W 1344 nt2.4□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 SRB8YCR081W 4284 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 SRB4YER022W 2064 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 PRE1YER012W 597 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 ERG28YER044C 447 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YGR283CYGR283C 1026 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RPS1AYLR441C 768 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YLR108CYLR108C 1458 nt2.39□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 IKI3YLR384C 4050 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 NAB6YML117W 3405 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 APC2YLR127C 2562 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 AXL1YPR122W 3627 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 NOP19YGR251W 591 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RNR2YJL026W 1200 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YKL066WYKL066W 444 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 GCD10YNL062C 1437 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 PEX27YOR193W 1131 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 ISW1YBR245C 3390 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 KAR4YCL055W 1008 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 ESL1YIL151C 3357 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 MSB2YGR014W 3921 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 SRD1YCR018C 666 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 MVB12YGR206W 306 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 GOS1YHL031C 672 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 PEX18YHR160C 852 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YIL174WYIL174W 228 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.3 ms