Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 PEX10YDR265W 1014 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YDR537CYDR537C 606 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 MYO3YKL129C 3819 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YLR171WYLR171W 390 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 AIM36YMR157C 768 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 PBI2YNL015W 228 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YBR051WYBR051W 351 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 snR41snR41 95 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 STI1YOR027W 1770 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 NOP4YPL043W 2058 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YJL132WYJL132W 2253 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 KAR9YPL269W 1935 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SRP68YPL243W 1800 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 RNT1YMR239C 1416 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 GEP4YHR100C 558 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 POG1YIL122W 1056 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 IGO1YNL157W 507 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YOR331CYOR331C 558 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 snR17asnR17a 333 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SVS1YPL163C 783 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 LTP1YPR073C 486 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YMR317WYMR317W 3423 nt3.31□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 MUB1YMR100W 1863 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 BNA7YDR428C 786 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YFL065CYFL065C 309 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YKL063CYKL063C 504 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 AFB1YLR040C 675 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YBR062CYBR062C 543 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 DAL5YJR152W 1632 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 FAS1YKL182W 6156 nt3.3□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 DSF2YBR007C 2211 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SSE2YBR169C 2082 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 RRI2YOL117W 1938 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SCY1YGL083W 2415 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SNA4YDL123W 423 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SPT2YER161C 1002 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YGR107WYGR107W 450 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YJL086CYJL086C 369 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SHH3YMR118C 591 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 RPL16BYNL069C 597 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 DNM1YLL001W 2274 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 URA2YJL130C 6645 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 REC8YPR007C 2043 nt3.29□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SYT1YPR095C 3681 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YAP6YDR259C 1152 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 FRQ1YDR373W 573 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YER119C-AYER119C-A 372 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YFR054CYFR054C 579 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 PDX1YGR193C 1233 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 RPI1YIL119C 1224 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YKT6YKL196C 603 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YLR076CYLR076C 423 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 RIM9YMR063W 720 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 ATG3YNR007C 933 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YNR021WYNR021W 1215 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YPR096CYPR096C 303 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SMC3YJL074C 3693 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 BMS1YPL217C 3552 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 PEX5YDR244W 1839 nt3.28□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 HBT1YDL223C 3141 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 SPT16YGL207W 3108 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 MDM1YML104C 3384 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 RSM24YDR175C 960 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 BI2Q0110 1272 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 AGA2YGL032C 264 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YGR017WYGR017W 894 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 SPO13YHR014W 876 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 NFU1YKL040C 771 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 RHO5YNL180C 996 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 TIM12YBR091C 330 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 snR42snR42 351 nt3.27□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 STU2YLR045C 2667 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 MPS1YDL028C 2295 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 UTP15YMR093W 1542 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 SMT3YDR510W 306 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YAP3YHL009C 993 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 ARC18YLR370C 537 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 MSH4YFL003C 2637 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 ADY4YLR227C 1482 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 MSB2YGR014W 3921 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YDR338CYDR338C 2088 nt3.26□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 HRD1YOL013C 1656 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 NSA2YER126C 786 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YGR073CYGR073C 372 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YKL044WYKL044W 321 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 SDH3YKL141W 597 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 CWC24YLR323C 780 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 RPL13BYMR142C 600 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 DDR48YMR173W 1293 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 MRPL40YPL173W 894 nt3.25□□□□□ -1.89
LCB4Q12246 YPR050CYPR050C 414 nt3.25□□□□□ -1.89
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