Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SLD5YDR489W 885 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 BAT1YHR208W 1182 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 CDC123YLR215C 1083 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 ATP11YNL315C 957 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 ATP20YPR020W 348 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YBR287WYBR287W 1284 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 CEP3YMR168C 1827 nt2.86□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 TFB1YDR311W 1929 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RGR1YLR071C 3249 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 VPS64YDR200C 1815 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 UBC13YDR092W 462 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 PNC1YGL037C 651 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 GPI14YJR013W 1212 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 JIP3YLR331C 378 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 BRX1YOL077C 876 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 POP7YBR167C 423 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 MBA1YBR185C 837 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RIM13YMR154C 2184 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 NSA1YGL111W 1392 nt2.85□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RPL11BYGR085C 525 nt2.84□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 YKR033CYKR033C 426 nt2.84□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 RPL11AYPR102C 525 nt2.84□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 NTC20YBR188C 423 nt2.84□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 ASI3YNL008C 2031 nt2.84□□□□□ -1.95
VPS54Q12071 JJJ2YJL162C 1752 nt2.84□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 TCB2YNL087W 3537 nt2.84□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 JSN1YJR091C 3276 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YOL057WYOL057W 2136 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YPL150WYPL150W 2706 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 STI1YOR027W 1770 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YCR013CYCR013C 648 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 HPA3YEL066W 540 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 LOC1YFR001W 615 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YGL109WYGL109W 324 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 TCD1YHR003C 1290 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 CPR7YJR032W 1182 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YLR257WYLR257W 966 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 NGL1YOL042W 1092 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YPL276WYPL276W 438 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 BOI1YBL085W 2943 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RSE1YML049C 4086 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 UTP14YML093W 2700 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RIF1YBR275C 5751 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 ANR2YKL047W 1551 nt2.83□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 CDC20YGL116W 1833 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 FIN1YDR130C 876 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YDR262WYDR262W 819 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RSM28YDR494W 1086 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YGR115CYGR115C 780 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 PCL5YHR071W 690 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YPT52YKR014C 705 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 LIP2YLR239C 987 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 URA5YML106W 681 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 CSI2YOL007C 1026 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 MAL33YBR297W 1407 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YGR067CYGR067C 2415 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 LST4YKL176C 2487 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YHR078WYHR078W 1659 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SLP1YOR154W 1764 nt2.82□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 ERG28YER044C 447 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SAE2YGL175C 1038 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YIL054WYIL054W 318 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 ECI1YLR284C 843 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YMR181CYMR181C 465 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YPR203WYPR203W 309 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SHG1YBR258C 429 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 ESC2YDR363W 1371 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 AGE1YDR524C 1449 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 AYT1YLL063C 1425 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 BIT61YJL058C 1632 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 KIN82YCR091W 2163 nt2.81□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SAP1YER047C 2694 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 PRP8YHR165C 7242 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SRB4YER022W 2064 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 ARK1YNL020C 1917 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 ERT1YBR239C 1590 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 THG1YGR024C 714 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RSR1YGR152C 819 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YGR283CYGR283C 1026 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 LIN1YHR156C 1023 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 MST28YAR033W 705 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RRG8YPR116W 834 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SEC7YDR170C 6030 nt2.8□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SRB8YCR081W 4284 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 NMA111YNL123W 2994 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 CWC22YGR278W 1734 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 POM152YMR129W 4014 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 CDC55YGL190C 1581 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 MIC19YFR011C 513 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SFT1YKL006C-A 294 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 RRG7YOR305W 729 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SUS1YBR111W-A 291 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 SEC66YBR171W 621 nt2.79□□□□□ -1.96
VPS54Q12071 ECM29YHL030W 5607 nt2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.1 ms