Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.31□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.31□□□□□ -2.04
UFD1P53044 SKO1YNL167C 1944 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 HFM1YGL251C 3564 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 ESL2YKR096W 3588 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 PEX6YNL329C 3093 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YEF3YLR249W 3135 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 MRPL9YGR220C 810 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YJL169WYJL169W 369 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YKL069WYKL069W 543 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 ATG10YLL042C 504 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 DYN3YMR299C 939 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 PDR17YNL264C 1053 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 PEX27YOR193W 1131 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 CIN2YPL241C 807 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 STN1YDR082W 1485 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YCL019WYCL019W 5313 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 ORC2YBR060C 1863 nt2.3□□□□□ -2.04
UFD1P53044 MRD1YPR112C 2664 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 SLD5YDR489W 885 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 GTR2YGR163W 1026 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 RSM27YGR215W 333 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YKE2YLR200W 345 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 UBC12YLR306W 567 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 PRM6YML047C 1059 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YNL089CYNL089C 477 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 KTI11YBL071W-A 249 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 RPL23AYBL087C 414 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 BTS1YPL069C 1008 nt2.29□□□□□ -2.04
UFD1P53044 MSH4YFL003C 2637 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 NUR1YDL089W 1455 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YKL115CYKL115C 393 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 MRPL38YKL170W 417 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 IPP1YBR011C 864 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 snR24snR24 89 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 SWD3YBR175W 948 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 YPL150WYPL150W 2706 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 VPS64YDR200C 1815 nt2.28□□□□□ -2.04
UFD1P53044 SRP1YNL189W 1629 nt2.28□□□□□ -2.05
UFD1P53044 RGR1YLR071C 3249 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 NOP12YOL041C 1380 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 NAB3YPL190C 2409 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 HOP1YIL072W 1818 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 RMD6YEL072W 696 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YGL159WYGL159W 1113 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 MVB12YGR206W 306 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 SMD2YLR275W 333 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 THI80YOR143C 960 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YOR277CYOR277C 309 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 SHG1YBR258C 429 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 ARP5YNL059C 2268 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 FKS3YMR306W 5358 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 ATP22YDR350C 2055 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 SWR1YDR334W 4545 nt2.27□□□□□ -2.05
UFD1P53044 DBF20YPR111W 1695 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 HMO1YDR174W 741 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 RSM24YDR175C 960 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 CPR5YDR304C 678 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 EMI1YDR512C 564 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 VAB2YEL005C 849 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YGR018CYGR018C 330 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 ARC18YLR370C 537 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 PRE8YML092C 753 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 ADI1YMR009W 540 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 MSN1YOL116W 1149 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 SEC26YDR238C 2922 nt2.26□□□□□ -2.05
UFD1P53044 AYT1YLL063C 1425 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 ATP16YDL004W 483 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YFR054CYFR054C 579 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YGL039WYGL039W 1047 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YHL044WYHL044W 708 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 MCR1YKL150W 909 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YLR050CYLR050C 486 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 CDC123YLR215C 1083 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 MRPL40YPL173W 894 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 KHA1YJL094C 2622 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 MLH1YMR167W 2310 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YKL100CYKL100C 1764 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YPK1YKL126W 2043 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 DNA2YHR164C 4569 nt2.25□□□□□ -2.05
UFD1P53044 SGS1YMR190C 4344 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 IRA2YOL081W 9240 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 snR70snR70 164 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 VEL1YGL258W 621 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 BTN2YGR142W 1233 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 BAT1YHR208W 1182 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YIL054WYIL054W 318 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 DAD2YKR083C 402 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 VMA6YLR447C 1038 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YMR187CYMR187C 1296 nt2.24□□□□□ -2.05
UFD1P53044 YNL043CYNL043C 321 nt2.24□□□□□ -2.05
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