Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YIL169CYIL169C 2988 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 BUD4YJR092W 4344 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 TCP1YDR212W 1680 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 PAM1YDR251W 2493 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 MSH4YFL003C 2637 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 MIC19YFR011C 513 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 CWH41YGL027C 2502 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 VEL1YGL258W 621 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 TFC4YGR047C 3078 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YGR293CYGR293C 462 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ERG11YHR007C 1593 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 MNT3YIL014W 1893 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 IST3YIR005W 447 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 APQ13YJL075C 417 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ENV10YLR065C 546 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ILV5YLR355C 1188 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ARC18YLR370C 537 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 UNG1YML021C 1080 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RPL6AYML073C 531 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 VPS20YMR077C 666 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RPL16BYNL069C 597 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 CSI2YOL007C 1026 nt3.06□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 GIS4YML006C 2325 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 MSB2YGR014W 3921 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 TOM70YNL121C 1854 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 STI1YOR027W 1770 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 SLX9YGR081C 633 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 STE18YJR086W 333 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 INP1YMR204C 1263 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YPL142CYPL142C 318 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 MRPL40YPL173W 894 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YPR172WYPR172W 603 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ITC1YGL133W 3795 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 VHR1YIL056W 1923 nt3.05□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 MAK21YDR060W 3078 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ROG1YGL144C 2058 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YDR193WYDR193W 399 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 TDA2YER071C 381 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RPB9YGL070C 369 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 PRS3YHL011C 963 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RPS21BYJL136C 264 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RPS16AYMR143W 432 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 MEI5YPL121C 669 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 AIM4YBR194W 372 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YLR278CYLR278C 4026 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RRM3YHR031C 2172 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ILS1YBL076C 3219 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 SPP382YLR424W 2127 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YME2YMR302C 2553 nt3.04□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ROM1YGR070W 3468 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 CBP2YHL038C 1893 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 NEL1YHR035W 1893 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 HOP1YIL072W 1818 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 SNA4YDL123W 423 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 FAR7YFR008W 666 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 LRP1YHR081W 555 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YHR213WYHR213W 597 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YAP5YIR018W 738 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YJL119CYJL119C 324 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YJL169WYJL169W 369 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 TDA8YAL064C-A 381 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YAR062WYAR062W 597 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 SMA2YML066C 1110 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ADI1YMR009W 540 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RIM9YMR063W 720 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 SHS1YDL225W 1656 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 RPA190YOR341W 4995 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 PDS5YMR076C 3834 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 YJL132WYJL132W 2253 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 SNQ2YDR011W 4506 nt3.03□□□□□ -1.92
YBL055CP34220 ECM21YBL101C 3354 nt3.03□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 VAS1YGR094W 3315 nt3.03□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 CEP3YMR168C 1827 nt3.03□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 SRC1YML034W 2505 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 STP2YHR006W 1626 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 snR84snR84 550 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 NCB2YDR397C 441 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 PRE1YER012W 597 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 AST2YER101C 1293 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 PEA2YER149C 1263 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 YJR141WYJR141W 1044 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 YAR069CYAR069C 294 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 ATP18YML081C-A 180 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 YBR051WYBR051W 351 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 TPK2YPL203W 1143 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 YPR050CYPR050C 414 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 FLO1YAR050W 4614 nt3.02□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 BNI4YNL233W 2679 nt3.01□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 RPN3YER021W 1572 nt3.01□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 YDR115WYDR115W 318 nt3.01□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 DYN2YDR424C 279 nt3.01□□□□□ -1.93
YBL055CP34220 RRT13YER066W 558 nt3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms