Protein–RNA interactions for Protein: P22217

TRX1, Thioredoxin-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRX1P22217 SAP1YER047C 2694 nt2.66□□□□□ -1.98
TRX1P22217 SPB1YCL054W 2526 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 UBP15YMR304W 3693 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 BRE5YNR051C 1548 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 FUS1YCL027W 1539 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 VAB2YEL005C 849 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YGL242CYGL242C 546 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YGR111WYGR111W 1203 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 MRP49YKL167C 414 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 HUA2YOR284W 732 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 CUP9YPL177C 921 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 NTC20YBR188C 423 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YLR446WYLR446W 1302 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 FLO11YIR019C 4104 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 MRD1YPR112C 2664 nt2.65□□□□□ -1.99
TRX1P22217 PDR1YGL013C 3207 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 PTP3YER075C 2787 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 SEM1YDR363W-A 270 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 HYP2YEL034W 474 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 PRE1YER012W 597 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YGL204CYGL204C 306 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YGR018CYGR018C 330 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YJR020WYJR020W 333 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 ATG19YOL082W 1248 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 RPB8YOR224C 441 nt2.64□□□□□ -1.99
TRX1P22217 SRO77YBL106C 3033 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 ARP5YNL059C 2268 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YCR016WYCR016W 873 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 snR76snR76 109 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 ALB1YJL122W 528 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 DNA2YHR164C 4569 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 SWA2YDR320C 2007 nt2.63□□□□□ -1.99
TRX1P22217 ART10YLR392C 1557 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 RIM13YMR154C 2184 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 GPI19YDR437W 423 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 MST27YGL051W 705 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YJL202CYJL202C 348 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YAL037WYAL037W 804 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YKL069WYKL069W 543 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 MPP6YNR024W 561 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YOL107WYOL107W 1029 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 RLF2YPR018W 1821 nt2.62□□□□□ -1.99
TRX1P22217 FKS3YMR306W 5358 nt2.61□□□□□ -1.99
TRX1P22217 SRB7YDR308C 423 nt2.61□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YGR050CYGR050C 357 nt2.61□□□□□ -1.99
TRX1P22217 NYV1YLR093C 762 nt2.61□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YOR055WYOR055W 435 nt2.61□□□□□ -1.99
TRX1P22217 LCL1YPL056C 306 nt2.61□□□□□ -1.99
TRX1P22217 HRD3YLR207W 2502 nt2.61□□□□□ -1.99
TRX1P22217 SRP1YNL189W 1629 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 MAK11YKL021C 1407 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 RIF1YBR275C 5751 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 PUF4YGL014W 2667 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 NUR1YDL089W 1455 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 KEI1YDR367W 666 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YKL115CYKL115C 393 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 RNP1YLL046C 750 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YKE2YLR200W 345 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 IRC21YMR073C 606 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 MTG1YMR097C 1104 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 RPL36AYMR194W 303 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YOR050CYOR050C 348 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YPR014CYPR014C 330 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YCT1YLL055W 1596 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 NEW1YPL226W 3591 nt2.6□□□□□ -1.99
TRX1P22217 ARP8YOR141C 2646 nt2.59□□□□□ -1.99
TRX1P22217 SAK1YER129W 3429 nt2.59□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.59□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YLR257WYLR257W 966 nt2.59□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YLR365WYLR365W 333 nt2.59□□□□□ -1.99
TRX1P22217 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.59□□□□□ -1.99
TRX1P22217 ATX1YNL259C 222 nt2.59□□□□□ -1.99
TRX1P22217 NSA1YGL111W 1392 nt2.59□□□□□ -2
TRX1P22217 INP51YIL002C 2841 nt2.59□□□□□ -2
TRX1P22217 YNL018CYNL018C 1839 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 SCY1YGL083W 2415 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 SLK19YOR195W 2466 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 snR70snR70 164 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 RUB1YDR139C 234 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 RGM1YMR182C 636 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 YOL162WYOL162W 648 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 RFC5YBR087W 1065 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 YBR090CYBR090C 369 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 ESC2YDR363W 1371 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 RGL1YPL066W 1440 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 PBS2YJL128C 2007 nt2.58□□□□□ -2
TRX1P22217 TPS2YDR074W 2691 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 ROY1YMR258C 1662 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 VPH2YKL119C 648 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 EMC6YLL014W 327 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 YAP7YOL028C 738 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 HEM4YOR278W 828 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 CBP6YBR120C 489 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 NUM1YDR150W 8247 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 COG3YER157W 2406 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 PHO2YDL106C 1680 nt2.57□□□□□ -2
TRX1P22217 SLH1YGR271W 5904 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.3 ms