Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTNP21246 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTNP21246 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTNP21246 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTNP21246 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTNP21246 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTNP21246 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms