Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BHMG1C9JSJ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms