Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP58Q9Y2X3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms