Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD20A3Q5VUR7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD20A3Q5VUR7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms