Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP25-1Q3LHN0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms