Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GRIN2AQ12879 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GRIN2AQ12879 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms