Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 RPL17BYJL177W 555 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 SOK1YDR006C 2706 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YJL049WYJL049W 1353 nt2.49□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 SLN1YIL147C 3663 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 TVP15YDR100W 432 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 GUK1YDR454C 564 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YGR018CYGR018C 330 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 PEX18YHR160C 852 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YHR213WYHR213W 597 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YIL054WYIL054W 318 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YJL114WYJL114W 681 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YJR020WYJR020W 333 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YKL066WYKL066W 444 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MCR1YKL150W 909 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 HYM1YKL189W 1200 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YAR062WYAR062W 597 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 NSA1YGL111W 1392 nt2.48□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 SRO77YBL106C 3033 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 NUM1YDR150W 8247 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YFR054CYFR054C 579 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YHL044WYHL044W 708 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 CMC1YKL137W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YLR365WYLR365W 333 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 ADI1YMR009W 540 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 MPP6YNR024W 561 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 APA1YCL050C 966 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 PBS2YJL128C 2007 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.47□□□□□ -2.01
RRP42Q12277 YCK2YNL154C 1641 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 PDS5YMR076C 3834 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 BUB1YGR188C 3066 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 AEP1YMR064W 1557 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 snR70snR70 164 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 HMO1YDR174W 741 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RSM24YDR175C 960 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 MAM1YER106W 909 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 VMA10YHR039C-A 345 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 AIM23YJL131C 1071 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YJR056CYJR056C 711 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YLR169WYLR169W 354 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 CDC123YLR215C 1083 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 FAR3YMR052W 615 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SRT1YMR101C 1032 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RCE1YMR274C 948 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 MRPL33YMR286W 261 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RPB8YOR224C 441 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YOR366WYOR366W 354 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 KHA1YJL094C 2622 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 NOP12YOL041C 1380 nt2.46□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YIL080WYIL080W 4722 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 TRA1YHR099W 11235 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YGL242CYGL242C 546 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 TCD1YHR003C 1290 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 ARC18YLR370C 537 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YOL162WYOL162W 648 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YOR050CYOR050C 348 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RRD2YPL152W 1077 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 PIG2YIL045W 1617 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SPT14YPL175W 1359 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SUL1YBR294W 2580 nt2.45□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SEN54YPL083C 1404 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RUB1YDR139C 234 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 HYP2YEL034W 474 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 GOS1YHL031C 672 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SED5YLR026C 1023 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YBL062WYBL062W 381 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YBP2YGL060W 1926 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YDR239CYDR239C 2364 nt2.44□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 ESA1YOR244W 1338 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 NEW1YPL226W 3591 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 NFT1YKR103W 3657 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SHR3YDL212W 633 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 VAB2YEL005C 849 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 GEP7YGL057C 864 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YIL141WYIL141W 390 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YKR070WYKR070W 1059 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RPF2YKR081C 1035 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 EMC6YLL014W 327 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 MMS1YPR164W 4224 nt2.43□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YOL057WYOL057W 2136 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 BOI1YBL085W 2943 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 ICR1ICR1 3199 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YNL193WYNL193W 1677 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 MDM10YAL010C 1482 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 SRD1YCR018C 666 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RPN9YDR427W 1182 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 RFA3YJL173C 369 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 MER1YNL210W 813 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 HSP10YOR020C 321 nt2.42□□□□□ -2.02
RRP42Q12277 YPL142CYPL142C 318 nt2.42□□□□□ -2.02
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