Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 SPP382YLR424W 2127 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YER067C-AYER067C-A 324 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 SNO3YFL060C 669 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 SNO2YNL334C 669 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 CTM1YHR109W 1758 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 DCG1YIR030C 735 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 POL5YEL055C 3069 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 PKH3YDR466W 2697 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 UBX3YDL091C 1368 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 SRD1YCR018C 666 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 MCM21YDR318W 1107 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 MTR2YKL186C 555 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YOR289WYOR289W 756 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YDL199CYDL199C 2064 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 MMS22YLR320W 4365 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 RLI1YDR091C 1827 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YPK3YBR028C 1578 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 EAF7YNL136W 1278 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 TCM62YBR044C 1719 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 PET100YDR079W 336 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 GRX3YDR098C 858 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 ARP10YDR106W 855 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 PRP18YGR006W 756 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 SOK1YDR006C 2706 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 SPC98YNL126W 2541 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 SPH1YLR313C 1593 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 RRP14YKL082C 1305 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 REV1YOR346W 2958 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YIR014WYIR014W 729 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YJR061WYJR061W 2808 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 HOP1YIL072W 1818 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YCK3YER123W 1575 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YCL019WYCL019W 5313 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 BUR6YER159C 429 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 MRPL9YGR220C 810 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 PRP3YDR473C 1410 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 YJL070CYJL070C 2667 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 TSR4YOL022C 1227 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 ARR2YPR200C 393 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 AGC1YPR021C 2709 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 GRX1YCL035C 333 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 RIX1YHR197W 2292 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 CSE4YKL049C 690 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 CRS5YOR031W 210 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 PRM2YIL037C 1971 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 QCR9YGR183C 201 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 SEN15YMR059W 387 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 TRM112YNR046W 408 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 MRPL27YBR282W 441 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 RPS29AYLR388W 171 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YOR029WYOR029W 336 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 MSN5YDR335W 3675 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YLR416CYLR416C 399 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 MBA1YBR185C 837 nt1.93□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 VHR1YIL056W 1923 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YJR003CYJR003C 1560 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 URC2YDR520C 2319 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 RPL1BYGL135W 654 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 CYC2YOR037W 1101 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 RPL1AYPL220W 654 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YCK2YNL154C 1641 nt1.92□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 VPS38YLR360W 1320 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 PLP1YDR183W 693 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YKR011CYKR011C 1062 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 MCT1YOR221C 1083 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 DIA2YOR080W 2199 nt1.91□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 EST3YIL009C-A 546 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 UTP25YIL091C 2166 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt1.9□□□□□ -2.1
TY1B-BRQ12193 YRR1YOR162C 2433 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 SIP4YJL089W 2490 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 NPL4YBR170C 1743 nt1.9□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 RGP1YDR137W 1992 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 AEP2YMR282C 1743 nt1.89□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 YDL073WYDL073W 2955 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 PRP38YGR075C 729 nt1.88□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 WBP1YEL002C 1293 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 RRF1YHR038W 693 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 VPH2YKL119C 648 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 BUR2YLR226W 1188 nt1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.3 ms