Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00205P59089 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms