Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YHR213WYHR213W 597 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YJL007CYJL007C 315 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 TDA8YAL064C-A 381 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YAR062WYAR062W 597 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YLR416CYLR416C 399 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RPN13YLR421C 471 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YMR144WYMR144W 1029 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 RRT1YBL048W 312 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SPC29YPL124W 762 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 TPK2YPL203W 1143 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 ARG2YJL071W 1725 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 SSE2YBR169C 2082 nt3.47□□□□□ -1.85
VFA1P40080 GAL80YML051W 1308 nt3.46□□□□□ -1.85
VFA1P40080 TIF4631YGR162W 2859 nt3.46□□□□□ -1.85
VFA1P40080 PMT6YGR199W 2280 nt3.46□□□□□ -1.85
VFA1P40080 LRG1YDL240W 3054 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YLR177WYLR177W 1887 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 BTT1YDR252W 450 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CHZ1YER030W 462 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RPL13BYMR142C 600 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 DYN3YMR299C 939 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 NCS2YNL119W 1482 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RRP5YMR229C 5190 nt3.46□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 SWC4YGR002C 1431 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RIM13YMR154C 2184 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 AKR1YDR264C 2295 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 SEG1YMR086W 2883 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 MET32YDR253C 576 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 PET54YGR222W 882 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CSE4YKL049C 690 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 FYV7YLR068W 456 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 MRPL44YMR225C 297 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 PDR17YNL264C 1053 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 PHR1YOR386W 1698 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CSR2YPR030W 3366 nt3.45□□□□□ -1.86
VFA1P40080 TOP1YOL006C 2310 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 NOP4YPL043W 2058 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 snR59snR59 78 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 BER1YLR412W 825 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RPS16AYMR143W 432 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RPL16BYNL069C 597 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RHO5YNL180C 996 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CSI2YOL007C 1026 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YOR277CYOR277C 309 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YBR051WYBR051W 351 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YPL205CYPL205C 345 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 FLO5YHR211W 3228 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YJL132WYJL132W 2253 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 HBT1YDL223C 3141 nt3.44□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YBR259WYBR259W 2067 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CCM1YGR150C 2595 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 OPI6YDL096C 327 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YLR076CYLR076C 423 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 PHO80YOL001W 882 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YDR061WYDR061W 1620 nt3.43□□□□□ -1.86
VFA1P40080 SKO1YNL167C 1944 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 ATP25YMR098C 1839 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 GCN1YGL195W 8019 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 HMLALPHA2YCL067C 633 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 MATALPHA2YCR039C 633 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 PHM6YDR281C 315 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 VPS74YDR372C 1038 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 EMI1YDR512C 564 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CDC26YFR036W 375 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 VEL1YGL258W 621 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YGR018CYGR018C 330 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RSR1YGR152C 819 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YIL175WYIL175W 318 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YJL086CYJL086C 369 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 SHE4YOR035C 2370 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CHS2YBR038W 2892 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RGL1YPL066W 1440 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 NSP1YJL041W 2472 nt3.42□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CHO2YGR157W 2610 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 SNA4YDL123W 423 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 VMA8YEL051W 771 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 PRM8YGL053W 714 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 Q0142Q0142 177 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 RPL15AYLR029C 615 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YLR224WYLR224W 1110 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YAR070CYAR070C 300 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 YPR053CYPR053C 456 nt3.41□□□□□ -1.86
VFA1P40080 CIN1YOR349W 3045 nt3.41□□□□□ -1.86
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