Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 VAS1YGR094W 3315 nt2.98□□□□□ -1.93
NDI1P32340 DRS2YAL026C 4068 nt2.98□□□□□ -1.93
NDI1P32340 NMD2YHR077C 3270 nt2.98□□□□□ -1.93
NDI1P32340 TOM1YDR457W 9807 nt2.98□□□□□ -1.93
NDI1P32340 ITC1YGL133W 3795 nt2.98□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YCL020WYCL020W 1317 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 TIF4631YGR162W 2859 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 MDM36YPR083W 1740 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 TAO3YIL129C 7131 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 EXO84YBR102C 2262 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 EMC4YGL231C 573 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YIP1YGR172C 747 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YOL029CYOL029C 606 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 RPL20BYOR312C 519 nt2.97□□□□□ -1.93
NDI1P32340 PEX6YNL329C 3093 nt2.96□□□□□ -1.93
NDI1P32340 GCD6YDR211W 2139 nt2.96□□□□□ -1.93
NDI1P32340 YME2YMR302C 2553 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YDR029WYDR029W 315 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 OCA6YDR067C 675 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 DSE2YHR143W 978 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 BUD19YJL188C 309 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SFT1YKL006C-A 294 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 INO4YOL108C 456 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 TIM12YBR091C 330 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 snR35snR35 204 nt2.96□□□□□ -1.94
NDI1P32340 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 TLC1TLC1 1301 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 PMR1YGL167C 2853 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 FUS2YMR232W 2034 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YCR013CYCR013C 648 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YKL070WYKL070W 510 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YLL044WYLL044W 447 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YKE2YLR200W 345 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YOR283WYOR283W 693 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 POL4YCR014C 1749 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 AVT5YBL089W 1380 nt2.95□□□□□ -1.94
NDI1P32340 MOT1YPL082C 5604 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YAT2YER024W 2772 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 DYN2YDR424C 279 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SLD5YDR489W 885 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 TMA20YER007C-A 546 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 RPL23BYER117W 414 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 PHD1YKL043W 1101 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SMA2YML066C 1110 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YNL203CYNL203C 612 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 MIX23YBL107C 591 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 GRE2YOL151W 1029 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 GCY1YOR120W 939 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YRO2YBR054W 1035 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SHG1YBR258C 429 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 CWH41YGL027C 2502 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 ANR2YKL047W 1551 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YIL169CYIL169C 2988 nt2.94□□□□□ -1.94
NDI1P32340 CTF13YMR094W 1437 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 UBX3YDL091C 1368 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 CRD1YDL142C 852 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YDL163WYDL163W 303 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 MIX14YDR031W 366 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 FMN1YDR236C 657 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 HLR1YDR528W 1272 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 VMA10YHR039C-A 345 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YET1YKL065C 621 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SEC14YMR079W 915 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YPR050CYPR050C 414 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 RPC40YPR110C 1008 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SUS1YBR111W-A 291 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 ILS1YBL076C 3219 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 ROM1YGR070W 3468 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 KAP104YBR017C 2757 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SMC2YFR031C 3513 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 RIX1YHR197W 2292 nt2.93□□□□□ -1.94
NDI1P32340 SYO1YDL063C 1863 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 UBP14YBR058C 2346 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YCT1YLL055W 1596 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 MFB1YDR219C 1398 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 PEX5YDR244W 1839 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 MRH1YDR033W 963 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YHR212CYHR212C 336 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YIL082WYIL082W 873 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YIL141WYIL141W 390 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YJR087WYJR087W 351 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 MRPL38YKL170W 417 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YAR060CYAR060C 336 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YMR187CYMR187C 1296 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YPL107WYPL107W 747 nt2.92□□□□□ -1.94
NDI1P32340 YOR296WYOR296W 3870 nt2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms