Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E1P29083 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms