Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCCP23508 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCCP23508 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCCP23508 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCCP23508 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCCP23508 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCCP23508 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCCP23508 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCP23508 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCP23508 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCCP23508 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms