Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RXRAP19793 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRAP19793 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRAP19793 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RXRAP19793 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RXRAP19793 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RXRAP19793 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RXRAP19793 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RXRAP19793 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RXRAP19793 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RXRAP19793 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RXRAP19793 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms