Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL2P13500 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL2P13500 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL2P13500 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCL2P13500 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCL2P13500 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCL2P13500 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCL2P13500 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms