Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TNIKQ9UKE5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TNIKQ9UKE5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TNIKQ9UKE5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms