Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC47Q96A33 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC47Q96A33 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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