Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNE4Q8N205 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNE4Q8N205 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms