Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 YKL100CYKL100C 1764 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 MET6YER091C 2304 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 LOC1YFR001W 615 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 MND1YGL183C 660 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YGR073CYGR073C 372 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YHR097CYHR097C 1101 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 RGI2YIL057C 495 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 SGN1YIR001C 753 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 ATG27YJL178C 816 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 MRPL20YKR085C 588 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 RLP24YLR009W 600 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YMR087WYMR087W 855 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YOL029CYOL029C 606 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 MPD2YOL088C 834 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 ARF3YOR094W 552 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YPL107WYPL107W 747 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 NIP7YPL211W 546 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 SLF1YDR515W 1344 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 ATG13YPR185W 2217 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 SLY41YOR307C 1362 nt2.85□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 SRC1YML034W 2505 nt2.84□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 BUD4YJR092W 4344 nt2.84□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 DTD1YDL219W 453 nt2.84□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.84□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 YIL082WYIL082W 873 nt2.84□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 RXT2YBR095C 1293 nt2.84□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 APD1YBR151W 951 nt2.84□□□□□ -1.95
RBD2Q12270 KIN3YAR018C 1308 nt2.84□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 ESA1YOR244W 1338 nt2.84□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 RAX2YLR084C 3663 nt2.84□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YJL049WYJL049W 1353 nt2.84□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 RGR1YLR071C 3249 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 ERG11YHR007C 1593 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 SRP1YNL189W 1629 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 SNQ2YDR011W 4506 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YJR020WYJR020W 333 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 SDH3YKL141W 597 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 GTT2YLL060C 702 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 ECI1YLR284C 843 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 IRC21YMR073C 606 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YNL203CYNL203C 612 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YOR387CYOR387C 621 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YPR172WYPR172W 603 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YMR046CYMR046C 1323 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 VPS9YML097C 1356 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 GWT1YJL091C 1473 nt2.83□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 TFC4YGR047C 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 NMD2YHR077C 3270 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 MUS81YDR386W 1899 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 EXO70YJL085W 1872 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YPD1YDL235C 504 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 DIG2YDR480W 972 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 SEC4YFL005W 648 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 NNF1YJR112W 606 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 DAD2YKR083C 402 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 ATG10YLL042C 504 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YLR297WYLR297W 390 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 GMC2YLR445W 567 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 GIM3YNL153C 390 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 GAL7YBR018C 1101 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YOR364WYOR364W 369 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 snR24snR24 89 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 TRS20YBR254C 528 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YCL020WYCL020W 1317 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 UBX3YDL091C 1368 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 MFB1YDR219C 1398 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 VHR2YER064C 1518 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 CEP3YMR168C 1827 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 MOT1YPL082C 5604 nt2.82□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 MPS1YDL028C 2295 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 STE23YLR389C 3084 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YCR108CYCR108C 192 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 FIN1YDR130C 876 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 HPA3YEL066W 540 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 NSA2YER126C 786 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 RPB9YGL070C 369 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YIP1YGR172C 747 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 PRS3YHL011C 963 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 STE18YJR086W 333 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 RPL15AYLR029C 615 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 GIM5YML094W 492 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YPR177CYPR177C 372 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 YPR203WYPR203W 309 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 SWD3YBR175W 948 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 SWC4YGR002C 1431 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 JSN1YJR091C 3276 nt2.81□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 PRP31YGR091W 1485 nt2.8□□□□□ -1.96
RBD2Q12270 RTT105YER104W 627 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79.4 ms