Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 MNT2YGL257C 1677 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 RSC6YCR052W 1452 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 PRM7YDL039C 2097 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 HTL1YCR020W-B 237 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 ATP17YDR377W 306 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 SCS22YBL091C-A 528 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 MCM4YPR019W 2802 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 BUD6YLR319C 2367 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 PKC1YBL105C 3456 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 OXP1YKL215C 3861 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 PMT4YJR143C 2289 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 SPC19YDR201W 498 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YEL075CYEL075C 369 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YER189WYER189W 369 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YGL052WYGL052W 306 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 AYR1YIL124W 894 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 SNZ2YNL333W 897 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 SRL1YOR247W 633 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 VIK1YPL253C 1944 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 FRS1YLR060W 1788 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 UTP15YMR093W 1542 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 TMA10YLR327C 261 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 URA10YMR271C 684 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YBL073WYBL073W 312 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 CBF5YLR175W 1452 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 TYW1YPL207W 2433 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 MVP1YMR004W 1536 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 EAP1YKL204W 1899 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 ASI1YMR119W 1875 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YIR040CYIR040C 333 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 SCS7YMR272C 1155 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 TOS3YGL179C 1683 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 ARE2YNR019W 1929 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 HOYDL227C 1761 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 snR55snR55 98 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 IRC4YDR540C 540 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YFR056CYFR056C 369 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YPR076WYPR076W 375 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 SPP382YLR424W 2127 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YSW1YBR148W 1830 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 APE3YBR286W 1614 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 SCW4YGR279C 1161 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 TAR1YLR154W-C 375 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YLR296WYLR296W 327 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 RPL26AYLR344W 384 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 FIT2YOR382W 462 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 ERI1YPL096C-A 207 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 ALD3YMR169C 1521 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 ICR1ICR1 3199 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 IMA1YGR287C 1770 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-BRQ12217 YEL014CYEL014C 306 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YER066C-AYER066C-A 501 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 ALG13YGL047W 609 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 PET191YJR034W 327 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 TVP18YMR071C 504 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YPL238CYPL238C 390 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 CTR86YCR054C 1692 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 ECM32YER176W 3366 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 CPS1YJL172W 1731 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 RKM1YPL208W 1752 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 LPP1YDR503C 825 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YIL141WYIL141W 390 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 RPL16BYNL069C 597 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YBR064WYBR064W 429 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 DBF4YDR052C 2115 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 DAK1YML070W 1755 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 EIS1YMR031C 2532 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 HOP1YIL072W 1818 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SPC72YAL047C 1869 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 PHO87YCR037C 2772 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 PDC1YLR044C 1692 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 SRC1YML034W 2505 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 IDP1YDL066W 1287 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 RPS5YJR123W 678 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YAR064WYAR064W 300 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 PRE8YML092C 753 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YBR197CYBR197C 654 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 FKH2YNL068C 2589 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 PSP1YDR505C 2526 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YDL062WYDL062W 426 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YET3YDL072C 612 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YLR230WYLR230W 306 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 ABZ1YNR033W 2364 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 CEP3YMR168C 1827 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 QDR3YBR043C 2070 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 KKQ8YKL168C 2175 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 YDR053WYDR053W 396 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 ERG28YER044C 447 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 PSY1YKL076C 384 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1A-BRQ12217 PPG1YNR032W 1107 nt5.11□□□□□ -1.59
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